В рамках научно-исследовательских работ Университет Кунаева проводит инициативные (финансируемые за счет собственных средств), а также прикладные (по заказу сторонних организаций) научно-исследовательские работы.

За последние 10 лет в академии реализованы более 10 крупных исследований в области юриспруденци и правоприменения.